El lugar ya tuvo una importante ocupación romana, destacando entre los hallazgos arqueológicos el Ara de las Ninfas (Museo Arqueológico Nacional), que indican la existencia en las inmediaciones de un templo romano y/o de unas termas o baños. Pero por lo que es mundialmente conocida la villa es por su excepcional Basílica de San Juan de Baños, fundada en el siglo VII por el rey visigodo Recesvinto –Monumento Nacional-.